2025-

• Szczypiński, P. M., Klepaczko, A., & Olbrycht, R. (2025). VesselKnife–software for the analysis of tubular structures in biomedical images. Computer Methods and Programs in Biomedicine, Volume 268, August 2025, 108817. doi pdf
• Błaszkowska, Z., Dzwonkowska, K., Stefański, P., & Szczypiński, P. M. (2025). Automated Segmentation of Wound and Scale Markers Areas Using a U-Net-Based Neural Network. In Nordic-Baltic Conference on Biomedical Engineering and Medical Physics, Polish Conference on Biocybernetics and Biomedical Engineering (pp. 493-505). Springer, Cham. doi

2020-2024

• P. M. Szczypiński (2024). Self-Report for the Procedure of Awarding the Title of Professor (in Polish). pdf reviews
• Kozłowski, M., Szczypiński, P. M., Reiner, J., Lampa, P., Mrzygłód, M., Szturo, K., & Zapotoczny, P. (2024). Identifying defects and varieties of Malting Barley Kernels. Scientific Reports, 14(1), 22143. doi pdf
• Strzelecki, M., Kociołek, M., Strąkowska, M., Kozłowski, M., Grzybowski, A., & Szczypiński, P. M. (2024). Artificial Intelligence in the detection of skin cancer: state of the art. Clinics in Dermatology doi pdf
• Szczypiński, P. M. (2023, June). Radius Estimation in Angiograms Using Multiscale Vesselness Function. In International Conference on Computational Science (pp. 230-244). Cham: Springer Nature Switzerland. doi pdf
• Florczyk, S. J., Hotaling, N. A., ... Szczypiński, P. M., ... & Simon Jr, C. G. (2023). Measuring dimensionality of cell‐scaffold contacts of primary human bone marrow stromal cells cultured on electrospun fiber scaffolds. Journal of Biomedical Materials Research Part A, 111(1), 106-117. doi pdf
• Szczypiński, P. M., & Sprawka, K. (2021). Orthorectification of Skin Nevi Images by Means of 3D Model of the Human Body. Sensors, 21(24), 8367. doi pdf
• Mayerhoefer, M. E., Materka, A., Langs, G., Häggström, I., Szczypiński, P., Gibbs, P., & Cook, G. (2020). Introduction to radiomics. Journal of Nuclear Medicine, 61(4), 488-495. doi pdf

  Chinese translation of Introduction to radiomics by Feng Yuan & Lan Xiaoli (2023) in Chinese Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging doi

2015-2019

• Szczypiński P.M., Klepaczko A. (2019) Deformable Mesh for Regularization of Three-Dimensional Image Registration. In: Pietka E., Badura P., Kawa J., Wieclawek W. (eds) Information Technology in Biomedicine. ITIB 2019. Advances in Intelligent Systems and Computing, vol 1011. Springer, Cham, ISBN: 978-3-030-23761-5, 67-78 doi pdf
• Sprawka K., Szczypiński P.M. (2019) Simulator for Modelling Confocal Microscope Distortions. In: Pietka E., Badura P., Kawa J., Wieclawek W. (eds) Information Technology in Biomedicine. ITIB 2019. Advances in Intelligent Systems and Computing, vol 1011. Springer, Cham, ISBN: 978-3-030-23761-5, 79-90 doi
• Kozłowski M., Szczypiński P.M. (2019) Barley Defects Identification by Convolutional Neural Networks. In: Pietka E., Badura P., Kawa J., Wieclawek W. (eds) Information Technology in Biomedicine. ITIB 2019. Advances in Intelligent Systems and Computing, vol 1011. Springer, Cham, ISBN: 978-3-030-23761-5, 187-198 doi pdf
• M. Kozłowski, P. Górecki & P. M. Szczypiński, Varietal classification of barley by convolutional neural networks, Biosystems Engineering, Vol. 184, August 2019, 155-165 doi link
• A. Klepaczko, P. Szczypiński, M. Strzelecki & L. Stefańczyk, Simulation of phase contrast angiography for renal arterial models, Biomedical engineering online 17.1 (2018): 41. doi
• Bajcsy, P., Yoon, S., Florczyk, S. J., Hotaling, N. A., Simon, M., Szczypinski, P. M., ... and Sriram, R. D. (2017). Modeling, validation and verification of three-dimensional cell-scaffold contacts from terabyte-sized images. BMC bioinformatics, 18(1), 526. doi
• Piotr M. Szczypiński, Artur Klepaczko, Marcin Kociołek, Barley defects identification, 10th International Symposium on Image and Signal Processing and Analyis, ISPA 2017, 216-219. doi
• Izabella Korczyńska-Czurak, Artur Klepaczko, Piotr M. Szczypiński, Vessel tree surface modeling for blood flow simulation, Signal Processing Algorithms Architectures Arrangements, and Application, SPA 2017, 111-115. doi
• Piotr M. Szczypiński, Artur Klepaczko, Marcin Kociołek, QMaZda – software tools for image analysis and pattern recognition, SPA 2017, 217-221. doi
• Karolina Szturo, Piotr M. Szczypiński, Ontology Based Expert System For Barley Grain Classification, SPA 2017, 360-364 doi
• Marcin Kociołek, Piotr M. Szczypiński, Artur Klepaczko, Preprocessing of barley grain images for defect identification, SPA 2017, 365-370 doi
• P. M. Szczypiński, A. Klepaczko, Chapter MaZda – A Framework for Biomedical Image Texture Analysis and Data Exploration in A. Depeursinge, O. S Al-Kadi, J. R. Mitchell (eds.), Biomedical Texture Analysis Academic Press 2017. ISBN: 978-0-12-812133-7, pp. 315-347 doi link
• Bajcsy, P., Yoon, S., Simon, M., Brady, M., Sriram, R., Hotaling, N., Schaub N., Simon C. G., Szczypinski P. M. & Florczyk, S. J. (2016, December). Modeling, validation and verification of cell-scaffold contact measurements over terabyte-sized 3D image collection. In Big Data (Big Data), 2016 IEEE International Conference on (pp. 3951-3953). doi
• Klepaczko, A., Szczypiński, P., Deistung, A., Reichenbach, J. R., & Materka, A. (2016). Simulation of MR angiography imaging for validation of cerebral arteries segmentation algorithms. Computer methods and programs in biomedicine, 137, 293-309. doi
• Zapotoczny, P., Szczypiński, P. M., & Daszkiewicz, T. (2016). Evaluation of the quality of cold meats by computer-assisted image analysis. LWT-Food Science and Technology, 67, 37-49. doi
• Klepaczko, A., Materka, A., Szczypinski, P., & Strzelecki, M. (2015). Numerical Modeling of MR Angiography for Quantitative Validation of Image-Driven Assessment of Carotid Stenosis. Nuclear Science, IEEE Transactions on, 62(3), 619-627. doi
• Szczypiński, P. M., Klepaczko, A., & Zapotoczny, P. (2015). Identifying barley varieties by computer vision. Computers and Electronics in Agriculture, 110, 1-8. doi pdf

2010-2014

• Szczypiński, P., Klepaczko, A., Pazurek, M., & Daniel, P. (2014). Texture and color based image segmentation and pathology detection in capsule endoscopy videos. Computer methods and programs in biomedicine, 113(1), 396-411. doi pdf
• Klepaczko, A., Szczypiński, P., Dwojakowski, G., Strzelecki, M., & Materka, A. (2014). Computer simulation of magnetic resonance angiography imaging: model description and validation. PloS One, 9(4) doi link pdf
• Klepaczko, A., Szczypiński, P., Strzelecki, M., & Materka, A. (2014). Numerical modeling of MR angiography for validation of image-driven quantitative diagnosis of intracranial aneurysm and carotid stenosis. EJNMMI Physics, 1(Suppl 1), A63. pdf
• Strzelecki, M., Szczypinski, P., Materka, A., & Klepaczko, A. (2013). A software tool for automatic classification and segmentation of 2D/3D medical images. Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section A: Accelerators, Spectrometers, Detectors and Associated Equipment, 702, 137-140. doi
• P. Szczypiński, A. Materka, Rozdział Geometryczne modele deformowalne do analizy i rozpoznawania obrazów
  w J. Mroczka (red.), Problemy Metrologii Elektronicznej i Fotonicznej, 2013;6:175-212, ISBN: 978-83-7493-784-9, Komitet Metrologii i Aparatury Naukowej PAN, Oficyna Wydawnicza Politechniki Wrocławskiej. pdf
• Szczypiński, P. M., & Zapotoczny, P. (2012). Computer vision algorithm for barley kernel identification, orientation estimation and surface structure assessment. Computers and Electronics in Agriculture, 87, 32-38. doi pdf
• Klepaczko, A., Szczypinski, P., Dwojakowski, G., Kocinski, M., & Strzelecki, M. (2012, September). Computer simulation of magnetic resonance angiography imaging. Parallel implementation in heterogeneous computing environment. In New Trends in Audio & Video and Signal Processing: Algorithms, Architectures, Arrangements, and Applications (NTAV/SPA), 2012 Joint Conference (pp. 43-48). IEEE. link
• P.M.Szczypiński, Komputerowa analiza obrazów z endoskopu bezprzewodowego dla diagnostyki medycznej, Rozprawa Naukowa, Zeszyty Naukowe Politechniki Łódzkiej, 2012 pdf
• M.E.Mayerhoefer, D.Stelzeneder, W.Bachbauer, G.H.Welsch, T.C.Mamisch, P.Szczypinski, M.Weber, N.H.G.M.Peters, J.Fruehwald-Pallamar, S.Puchner & S.Trattnig, Quantitative analysis of lumbar intervertebral disc abnormalities at 3.0 Tesla: value of T2 texture features and geometric parameters, NMR in Biomedicine, June 2012, vol. 25(6), pp. 866-872, doi
• P.M.Szczypiński, A.Klepaczko & M.H.Strzelecki, An Intelligent Automated Recognition System of Abnormal Structures in WCE Images, Lecture Notes in Artificial Intelligence, 2011, vol. 6678, pp. 140-147 doi
• M.Strzelecki, A.Materka, M.Kociński, P.Szczypiński, A.Deistung & J.Reichenbach, Ocena metody zbiorów poziomicowych stosowanych do segmentacji trójwymiarowych obrazów fantomów cyfrowych oraz obrazów naczyń krwionośnych mózgu TOF-SWI rezonansu magnetycznego, Inżynieria biomedyczna, 2/2010 vol.16, pp. 167-172
• P.M.Szczypiński & A.Klepaczko, Wykrywanie zmian patologicznych w filmach z endoskopu bezprzewodowego, VI Sympozjum Naukowe, Techniki Przetwarzania Obrazu, TPO 2010
• A. Klepaczko and P. Szczypiński, Automated Segmentation of Endoscopic Images Based on Local Shape-Adaptive Filtering and Color Descriptors, Advanced Concepts for Intelligent Vision Systems, Lecture Notes in Computer Science, 2010, Volume 6474/2010, 245-254, doi link
• A. Klepaczko, P. Szczypiński, P. Daniel & M. Pazurek, Local Polynomial Approximation for Unsupervised Segmentation of Endoscopic Images, 2010 Computer Vision and Graphics, Lecture Notes in Computer Science, Vol. 6375, pp. 33-40 doi pdf
• P. Szczypiński, P. Pełczyński, D. Szajerman & P. Strumiłło, Implementation of Computer Vision Algorithms in DirectShow Technology, Image Processing and Communications Challenges 2, Advances in Intelligent and Soft Computing, 2010, Vol. 84, pp. 31-38 doi pdf
• P. Szczypiński & A. Klepaczko, Automated Recognition of Abnormal Structures in WCE Images Based on Texture Most Discriminative Descriptors, Image Processing and Communications Challenges 2, Advances in Intelligent and Soft Computing, 2010, Vol. 84, pp. 263-270 doi
• M. Strzelecki, A. Materka, M. Kociński, P. Szczypiński, A. Deistung & J. Reichenbach, Ocena metody zbiorów poziomicowych stosowanych do segmentacji trójwymiarowych obrazów fantomów cyfrowych oraz obrazów naczyń krwionośnych mózgu TOF-SWI rezonansu magnetycznego, Inżynieria biomedyczna, 2/2010 vol.16, pp. 167-172 pdf
• A. Klepaczko & P. Szczypiński, Algorytm lokalnej aproksymacji wielomianowej w zastosowaniu do segmentacji obrazów endoskopowych, XVI Krajowa Konferencja Biocybernetyka i Inżynieria Biomedyczna, 2010, pp. 67

2005-2009

• Agnieszka Skowrońska, Dariusz Mikulski, Marzena Mikulska, Piotr Zapotoczny, Izabela Zmysłowska, P.M. Szczypiński, Methodological aspects and applications of fluorescent in situ hybridization to identify bacteria from the gastrointestinal tract of turkeys, Veterinarija ir Zootechnika ISSN 1392-2130, 2009 No. 48 (70) pp. 65-71 link pdf
• P. Szczypiński and A. Klepaczko, Convex Hull-Based Feature Selection in Application to Classification of Wireless Capsule Endoscopic Images, in Book Series Lecture Notes in Computer Science, Volume 5807, Springer 2009, 664-675 doi link pdf
• Piotr Szczypinski, Artur Klepaczko, Selecting Texture Discriminative Descriptors of Capsule Endpscopy Images, Proceedings of the 6th International Symposium on Image and Signal Processing and Analysis, ISPA 2009, 701-706 link pdf
• M. Strzelecki, P. Szczypinski, A. Materka, M. Kocinski, A. Sankowski, Level-set segmentation of noisy 3D images of numerically simulated blood vessels and vascular trees, ISPA 2009, 742-747
• A. Materka, M. Strzelecki, P. Szczypinski, M. Kocinski, A. Deistung, J. R. Reichenbach, Arteries tracking in simultaneous TOF-SWI MR images: image characteristics and preliminary results, ISPA 2009, 748-753
• Piotr M. Szczypiński, Ram D. Sriram, Parupudi V.J. Sriram, D. Nageshwar Reddy, A model of deformable rings for interpretation of wireless capsule endoscopic videos, Medical Image Analysis, Volume 13, Issue 2, April 2009, 312-324 doi pdf
• Piotr M. Szczypiński, Michal Strzelecki, Andrzej Materka, Artur Klepaczko, MaZda - A software package for image texture analysis, Computer Methods and Programs in Biomedicine, Volume 94, Issue 1, April 2009, 66-76 doi pdf
• P. M. Szczypiński, M. Strzelecki, A. Materka and A. Klepaczko, MaZda - The Software Package for Textural Analysis of Biomedical Images, in Book Series Advances in Soft Computing, Volume 65, Springer 2009, Book Computers in Medical Activity, 73-84 link
• P. Szczypiński, M. Strzelecki, A. Materka, MaZda - a Software for Texture Analysis, Proc. of ISITC 2007, November 23-23, 2007, Jeonju, Korea, pp. 245-249 link
• P. Szczypinski, Sterowanie odtwarzaniem wideo z endoskopu bezprzewodowego za pomocą współczynnika deformacji modelu deformowalnych pierścieni, XV Krajowa Konferencja Naukowa Biocybernetyka i Inżynieria Biomedyczna, Wrocław, Polska, Wrzesień 2007, str. 287 link
• P. Szczypinski, Michał Strzelecki, Andrzej Materka, Artur Klepaczko, MaZda - the software package for textural analysis of biomedical images, Proc. of International Conference on Computers in Medical Activity, Łódź, Poland, September 2007 link
• P. Szczypinski, Computer Program for Aiding in Wireless Endoscopic Video Interpretation, Proc. of International Conference on Computers in Medical Activity, Łódź, Poland, September 2007
• A. Deistung, M. Kocinski, P. Szczypinski, A. Materka, J. R. Reichenbach, Segmentation of venous vessels using multi-scale vessel enhancement filtering in susceptibility weighted imaging, 14th ISMRM, Seattle, WA, 6-12 May 2006, pp. 1948 link
• M. Strzelecki, A. Materka, P. Szczypinski, Chapter MaZda in M. Hajek, M. Dezortova, A. Materka, R. Lerski (eds.), Texture Analysis for Magnetic Resonance Imaging, Med4publishing, Prague, 2006. ISBN: 80-903660-0-7, pp. 105-111 link
• P.M. Szczypiński, Przetwarzanie danych video z endoskopu bezprzewodowego za pomocą modelu deformowalnych pierścieni, Sympozjum TPO 2006, Serock pdf
• P.M. Szczypinski, Selecting a motion estimation method for a model of deformable rings, Proc. International Conference on Signals and Electronic Systems, September 2006, Lodz, Poland, pp. 297-300 pdf
• P.M. Szczypinski, P.V.J. Sriram, R.D. Sriram, and D.N. Reddy, Przetwarzanie i wspomaganie interpretacji danych z endoskopu bezprzewodowego za pomocą modelu deformowalnych pierścieni, Zeszyty Naukowe Elektronika, Instytut Elektroniki PŁ, Nr 10, 2005, pp. 129-147 pdf

2000-2004

• P.M. Szczypinski, Center Point Model of Deformable Surface, Computer Vision and Graphics, International Conference, ICCVG 2004, Warsaw, Poland, September 2004; 2006 Springer: pp.343-348 link pdf
• P.M. Szczypinski, P.V.J. Sriram, R.D. Sriram, D.N. Reddy, Model of Deformable Rings for Aiding the Wireless Capsule Endoscopy Video Interpretation and Reporting, Computer Vision and Graphics, International Conference, ICCVG 2004, Warsaw, Poland, September 2004; 2006 Springer: pp.167-172 link pdf
• Szczypinski P.M., Sriram P.V.J., Sriram R.D., Reddy D.Computerized Image Analysis of Wireless Capsule Endoscopy Videos Using a Dedicated Web-like Model of Deformable Rings - A Feasibility Study, 12th UNITED EUROPEAN GASTROENTEROLOGY WEEK, September 2004, Prague, Poster and Abstract in Endoscopy 2004; 36 (Suppl. I) A76 pdf
• Thybo, A.K., Karlsson, A.H., Bertram, H.C., Andersen, H.J., Szczypinski, P.M. and Donstrup, S., Nuclear Magnetic Resonance (NMR) and Magnetic Resonance Imaging (MRI) in texture measurement (Ed: D. Kilcast) In: TEXTURE IN FOOD VOLUME 2: SOLID FOODS. 2004, Woodhead Publishing Ltd(pp 184-200) doi link
• Anette K. Thybo, Piotr M. Szczypinski, Anders H. Karlsson, Sune Donstrup, Hans S. Stodkilde-Jorgensen, Henrik J. Andersen, Prediction of sensory texture quality attributes of cooked potatoes by NMR-imaging (MRI) of raw potatoes in combination with different image analysis methods, Journal of Food Engineering, Elsevier 2004, pp. 91-100 doi pdf
• M. Kociołek, A. Materka, M. Strzelecki, P. Szczypiński, Descrete Wavelet Transform-Derived Features for Digital Image Texture Analysis, International Conference on Signals and Electronic Systems, Łódź-Poland 2001, pp.99-104
• J. Jaksa, K. Ślot, P. Szczypiński, Face Recognition Using Deformable Models, International Conference on Signals and Electronic Systems, Łódź-Poland 2001, pp.111-116
• P. Szczypiński, M. Kociołek, A. Materka, M. Strzelecki, Computer Program for Image Texture Analysis in PhD Students Laboratory, International Conference on Signals and Electronic Systems, Łódź-Poland 2001, pp.255-262 pdf
• P. Szczypiński, Streszczenie rozprawy doktorskiej: Modele deformowalne do ilościowej analizy i rozpoznawania obiektów w obrazach cyfrowych, Wydział Elektrotechniki i Elektroniki Politechniki Łódzkiej, Łódź 2000 pdf
• P. Szczypiński, Rozprawa doktorska: Modele deformowalne do ilościowej analizy i rozpoznawania obiektów w obrazach cyfrowych, Wydział Elektrotechniki i Elektroniki Politechniki Łódzkiej, Łódź 2000 pdf
• M. Kociołek, A. Materka, M. Strzelecki, P. Szczypiński, Investigation of Wordlength Effect on Discriminative Power of Co-occurrence Matrix - Derived Features for Digital Image Texture Analysis, International Conference on Signals and Electronic Systems, Ustroń-Poland 2000, pp.163-168
• P. Szczypiński, A. Materka, Object Tracking and Recognition Using Deformable Grid with Geometrical Templates, International Conference on Signals and Electronic Systems, Ustroń-Poland 2000, pp.169-174 pdf
• M. Kociołek, A. Materka, M. Strzelecki, P. Szczypiński, Badanie wpływu liczby poziomów jasności obrazu na zdolność dyskryminacji tekstur przy użyciu macierzy zdarzeń, Elektronika-Prace naukowe, Łódź 2000, Zeszyt nr 5, pp.21-33
• P. Szczypiński, A. Materka, Program do analizy obrazów za pomocą deformowalnych modeli, Elektronika-Prace naukowe, Łódź 2000, Zeszyt nr 5, pp.33-51 pdf

1995-1999

• P. Szczypiński, A. Materka, Variable-Flexibility Elastic Model for Digital Image Analysis, Bulletin of the Polish Academy of Sciences, Technical Sciences, Vol.47, No.3, 1999, pp. 263-269
• P.Szczypiński, A. Materka, Variable-Flexibility Elastic Model for Digital Image Analysis, XXI KKTOiUE, Kiekrz, 1998 pdf
• P. Strumiłło, J. Niewczas, P. Szczypiński, P. Makowski, W. Woźniak, Computer System for Analysis of X-Ray Images of Wheat Grains, Int. Agrophysics, 1999, 13, pp. 133-140 link pdf
• P. Strumiłło, P. Szczypiński, P. Makowski, J. Niewczas, Program do Komputerowej Analizy Obrazów Rentgenowskich Ziaren Pszenicy, WEE PŁ Elektronika-Prace naukowe, Łódź 1997, Zeszyt nr 2, pp.101-111
• P. Strumiłło, P. Szczypiński, P. Makowski, Dokumentacja skomputeryzowanego stanowiska badawczego do analizy obrazów rentgenowskich ziaren pszenicy, Instytut Elektroniki, Politechnika Łódzka, 1996
• P. Szczypiński, P. Strumiłło, Application of an Active Contour Model for Extraction of Fuzzy and Broken Image Edges, Machine GRAPHICS & VISION, Vol.5, No.4, 1996, pp. 579-594 pdf
• P. Strumiłło, P. Szczypiński, Automatic Extraction of Fuzzy and Broaken Image Edges using Active Contour Model, XVIII KKTOiUE, 1995
• P. Szczypiński, Modulator PAL do komputera PC z kartą VGA lub SVGA, Elektronika Praktyczna, luty 1995, pp. 59-61 link pdf